If a table contains an AUTO_INCREMENT column and INSERT ... UPDATE inserts a row, the LAST_INSERT_ID() function returns the AUTO_INCREMENT value. If the statement updates a row instead, LAST_INSERT_ID() is not meaningful. However, you can work around this by using LAST_INSERT_ID(expr). Suppose that id is the AUTO_INCREMENT column. To make LAST_INSERT_ID() meaningful for updates, insert rows as follows:
INSERT INTO table (a,b,c) VALUES (1,2,3)
ON DUPLICATE KEY UPDATE id=LAST_INSERT_ID(id), c=3;

if a table contains an AUTO_INCREMENT column and INSERT ... ON DUPLICATE KEY UPDATE updates (rather than inserts) a row, the value of LAST_INSERT_ID() is not meaningful

last_insert_id() такая конструкция может возвращать 0 цитирую книгу "возвращает значение функции auto_increment, которое было сгенерировано последним во время текущего сеанса работы сервера "
т.е. если с момента вставки вы гасили сервер то будет 0

проверь, не разрываешь ли ты соединение в процессе вставки и получения этого last_insert_id() , т.е. типо это все дожно быть одновременно в течении одного сеанса

Хреновые клиенты как правило выполняют каждый запрос в своем соединении. Поэтому и last_insert_id() нулевой. Так что зайдите ка лучше в mysql.exe и попробуйте оттуда.

Для проверки можете открыть два клиента, вставить в одном строку и выполнить в обоих
select last_insert_id()
получите в одном случае N во втором 0