Без доступа к выполнению команд на сервере:
1.принять факсом или на мыльцо файл-список от админа того сервера.
2. Vital написАл;
3. ShAnKaR написАл;
4. Crawling.
С доступом к выполнению команд:
dir (win)
ls (unix)
CentOs есть ли баги и как получить абсолютно весь спиок включая папки ядра линукс
Это уже тебе нужно внутрь пролазить. Можно получить поверхносно, тогда ищи раскрытие пути, проверь, может заиндексировались ошибки в поисковике.
Список директорий - только брутом. И не забудь про файл роботс - там часто вкусненькое лежит =)