Для HDD проверить скорость работы как обычным копированием файлов так и CrystalDiskMark3_0_3a
Посмотри SMART диска, возможно он уже умирает. Можно и тут выложить под спойлером...
Вот копирование файлов я бы точно никому не стал бы советовать, особенно если диск начинает сыпаться. Только усугубит ситуацию...
А так смарт хорош. Еще можно утилиту badblocks посоветовать, но она вроде только под линух. Записывает битые сектора в файл, который потом можно использовать для того, чтобы их пометить