Восстановить это понятно, но чудо-файл в бэкапе останется же. Я помню один раз Яндекс блокирнул за вирус на сайте. Очень долго выковырять его не могли. Выдача и трафик улетели на долгое время. Месяцев 6 восстанавливался трафик, если не больше.