есть файл /usr/sbin/suexec с атрибутами root/apache -r-s--x---
по идее Суекзек позволятет запустить скрипт с правами рута. Пробовал, но толком ничего не вышло, есть ли в этом смысл ?
Результат выполнения команды suexec -V

bash-2.05b$ bash-2.05b$ suexec -V
-D AP_DOC_ROOT="/var/www"
-D AP_GID_MIN=100
-D AP_HTTPD_USER="apache"
-D AP_LOG
_EXEC="/var/log/httpd/suexec.log"
-D AP_SAFE_PATH="/usr/local/bin:/usr/bin:/bin"
-D AP_UID_MIN=500
-D AP_USERDIR_SUFFIX="public_html"


/var/log/httpd -read, write рут онли!
есть права на запись в /var/www
uid и gid апача 48
LoadModule suexec_module modules/mod_suexec.so
модуль подключен в конфиге апача.