На SATA-винтах перемычки есть, только они отвечают за скорость самого HDD - иногда, когда старый винт не работает на новой матери, можно поставить перемычку и скорость интерфейса винта упадет с 3 до 1.5
SATA тоже можно поставить как мастер или раб - на материнской плате разъемы обычно помечены.
Но память я бы все таки потестировал. И BIOS сбросил - вдруг что намудрил с настройками, например тайминги слишком задрал.