1. Поставил настройки в биос (режим контроллера Raid). Должен появиться в списке загрузки один общий том. Далее в тулзе конфигурирования (загружается после биос) выбрал режим 0 или 1. Если Matrix Raid, то можно сделать поинтереснее, я например делал так https://forum.antichat.ru/thread61860.html
2. Когда будешь ставить винду, установщик спросит, хотите ли вы установить специфичные раид, скази и т.д. Вот тут и надо подсунуть на дискете драйвер для раид контроллера. Обычно на диске от матери есть либо тулза, либо образ дискеты, либо сами дрова. Т.е. надо скинуть для удобства дрова либо на дискету, либо на флешку.
Далее проблем возникнуть не должно....
PS Что касается интегрирования в дистрибутив дров, то воспользуйся спец. софтом для этого.