Если у Вас там 1С, то лучше исключить TCP/IP. 1C кривовато с ним работает. Самый прекрасный вариант использование IPX/SPX или NetBIOS. Нет смысла стрелять с пушки по воробьям. Это так к слову.
Ты про backup'ы чего говоришь? Если 1С, то можешь попробовать Paragon Drive Backup или Handy Backup.
Можешь сам написать скрипт и засунуть его в планировщик. Вариантов уйма.
Не уверен в HDD воспользуйся RAID массивом