в .htaccess права
строчка ErrorDocument 404 http://***/404.htm
например.
Данная строчка отвечает за редирект, но не мешает залить шелл.
либо там же стоит запрет, скажем правило
<FilesMatch "рег.выражение">
парвила....
</Files>
снести можно путем редактирования самого .htaccess, для этого те нужен шелл.
парадокс.