Ответ не эксперта, но все таки я считаю, что нужно подключить винт либо к другому компу и попытаться найти вирус, либо загрузиться с загрузочной дискеты или диска.
Не всегда помогает! Если он не палиться виросом то его фиг отыщешь, будет в папке с виндой балтаться и его от системных не отличить будет.
Я раз столкнулся с тем что и в безопасном режиме банер висел, но он потом закрылся а как я так и не понял Но и то было фигово експлорер не запущен диспетчер закрыт, в общем ужас))