Если нет необходимости сохранять установленную систему - то тут простор для деятельнорсти ограничивается только фантазией и личными предпочтениями. Можно, например, поставить специально заточенный под это дело дистрибутив (untangle или любой другой по желанию).
Если ситему менять не хочется или не можется - тогда смотреть в сторону биллинговых систем. Из бесплатных - NiTraf, TRAFFPRO, NetAms - для поставленной задачи подойдет любой, я рекомендовал бы traffpro.