Под систему однозначно SSD.
Минусов нет (забудьте про количество циклов записей/перезаписей, давно уже не актуально и т.д.), кроме того, что в ноутбуке будет потреблять постоянно одинаково, в отличии от HDD, который в состоянии простоя потребляет меньше SSD.
SSD - для системы, SSHD - для "файлопомойки" (игры, большие приложения, ака Visual Studio, но кэш студио лучше настроить на работу с RAMDisk'ом). И да, для TEMP/TMP советую выделить 1-2 гигабайта ОЗУ под RAMDisk и использовать его + туда же настроить кэш браузеров, чтобы они не ели циклы записи SSD.