Получаем сайт уже без CloudFlare.Дальше уже спокойно можно работать с софтом и проводит аудит не только веб-приложения но и целевой системы(сканить порты,сервисы и т.д...)
Еще как вариант можно использовать утилитку DIG для того что разкрыть возможные dns-имена,затем пинговать их:
Но в нашем случае все записи не принадлежат реальному IP (
Еще один способ разкрытия реального IP сайта - это через почту.Это может быть регистрация на сайте или любой другой способ вынудить отправить вам письмо с веб сервера.И в теле письма посмотреть IP адрес.