Посмотрел бы я как вы смержите около 1000 классов за 6 часов

Нужно 2-3 вида декомпиляторов (они сейчас ну очень доступны), разные декомпиляторы могут дать разные результаты на разные виды классов, нужно +- знать базу сборки, у любой сборки есть свой зашаренный эквивалент, он понадобится чтобы фиксить парсеры и подобные вещи т.к декомпиляторы часто делают не правильные конвертации обьектов. Примерно до 6 часов и терпение. Потом нужно примерно неделя чтобы это все оттестировать на 30 онлайне и вперед. Кто сейчас думает, о да, у меня обфускатор, любой обфускатор можно снять, так что...безопасность сборок - это ваши клиенты и с кем они работают.

не актуально уже?

Не думаю, что автор пол года сидел ждал ответа)