В таблице есть поле указанное как primary key или unique key (их объединяет то, что значения в поле должны быть уникальными).
Если в базе уже есть данные и ты пытаешься импортировать поверх, будет вылетать ошибка, т.к. старые записи не затираются, а новые MySQL создать не может из-за не уникальности значения в поле.
Я при импорте обычно чищу таблицу от данных, тогда проблем не возникает .