Разные схемы действия скриптов. Лучше всего по датацентрам смотреть, а там уже смотреть, какая цифра преимущественна, та и есть действительной.
Я сам юзаю софтину Site Auditor, там проверка PR меня еще не подводила.

http://epavel.ru/tools/google-pr-checker/

можно выбрать датацентр

__________________
God forgive me for I have sinned
It’s been six months since my last confession
There is nowhere that I can run to
My soul I place in your hands

У гугла разные датасерверы, и разным серверам в зависимости от IP может выдаваться разное значение. Так же и в выдаче в серпе отличается.

верь тулбару гугловскому

В разных ДЦ разные значания - значит начался ап =)