Сам сталкивался с проблемой на хибернейте в обновлении переменных в последовательности память-бд-память. Это сложно дебажить и важные реал тайм данные намного удобнее было бы получать в обход оптимизаций хибернейта. Поэтому голосую за.

Но отказываться полностью от его фич совсем нет смысла: частое чтение стоит кэшировать, lazy initialization тоже полезно. Я бы разделил управление. Например, если грузятся новости - насколько важно что в момент загрузки будет отображаться старая новость ещё несколько секунд?(Наверное не важно) Или наоборот, важно ли загрузить новые данные пользователя, который только что сменил пароль и пытается выполнить вход?(Наверное важно)

Но опыта использования spring jdbc у меня нет, возможно там будут свои подводные камни.