Кнопка "Run" не всегда и не у всех работает, по этому отдельно запускаеш кейген (в первый раз) и отдельно командой ./java -noverify -Xbootclasspath/p:burp-loader-keygen-2_1_04.jar -jar burpsuite_pro_v2.1.04.jar сам бурп, только версии подставляй, после активации можно сразу запускать бурп командой.