Конечно копать килобайты кода не очень привлекательно, но в случае с этим конкретным сокс врапером "IO::Socket::Socks::Wrapper" обычно достаточно добавить в начале скрипта:

после #!/usr/bin/perl

Это для тор.

И где дальше идет вызов сетевых функций не особо важно.

Активно юзаю в своих програмах пока он не подводил.

Конечно с nikto может и не заработает так просто, но что мешает попробовать?

Запустить снифер и посмотреть куда идут коннекты.