Накрывать ВМками файл и вшивать прямо в не очевидный файл. Допустим использовать VMProtect или Themida и так далее. Но если станет вопрос и заплатят деньги что бы это отключить, ну примерно 40-80 USD цена вопроса и по времени день и или пол.