Никогда не заморачивался по этому поводу. Только для ps3 форматировал флешку и внешний hdd в fat32, по тому что она другой формат не понимает.

Смотря как будет использоваться флешка. Если например фильмы смотреть в хорошем качестве, форматирую в NTFS, в остальном FAT32. Но чтобы это влияло на их жизнь не замечал.

Да тоже флешки форматирую в FAT32,а если жёский переносной в коробке,то конечно же в NTFS

У меня внешний переносной хард для работы. На нём два раздела, один с которого системы ставятся и аварийка в FAT32. Когда биос перепрошить да и прочее fat32 просто необходим. Так вот у меня два харда таких второй в NTFS и скажу со всей ответственностью первый более работоспособен для своих задач. Например не у всех супер компы и со старенькими адаптируется fat32 на ура, а вот с ntfs подводит часто. Также что касается флешек, у меня в машине магнитола тока fat32 понимает, думаю так у многих. Для флешки все таки фат32 более универсальна.

Флешки стараюсь держать в fat32, переносные жесткие - ntfs (или hfs+).

Да тут собственно - кому что нравится. Писал уже выше. Кстати, может быть флешка нужна под дос, тогда нтфс не пойдет, вернее без мучений не пойдет )

Функций безопасности, которые есть в NTFS, в FAT32 нет. Главный же недочет FAT32, как не раз уже упоминалось - ограничение по объему.

По объему то это понятно. Но можно подробнее о "Функций безопасности"?

разграничение прав пользователей на файлы и каталоги, шифрование.
этим на самом деле редко кто пользуется.
тем не менее NTFS более надежный, журналирование и все операции с данными выполняются транзакциями,
что позволяет понизить потерю данных в случае сбоев.