Может быть, своп-файл? Он по умолчанию не видим..

System Volume Information?
мож часть битых кластеров закрыли доступ к последующим?

__________________
*********************************
*Я не волшебник ٩(๏̯͡๏)۶, только учусь...*
*********************************
Программы на заказ
Times to fly...

Чекдиск попробуй.

В смысле?

Пуск - Выполнить - chkdsk C: /F
Можно и без /F чтобы убедится есть ли там ошибка.

Если есть он должен выдать что-то типа:

В рисунке основной таблицы файлов обнаружено свободное место, помеченное как выделенное.
В рисунке тома обнаружено свободное место, помеченное как выделенное.

2Allen
1)Необходимо хотябы иногда делать дефрагментацию жёсткого диска.
2)Желательно простестировать свой винчестер программой MHDD 2.8
Этот софт предназначен для тестирования винчестера на BAD-сектора.
Возможно твои проблеммы из за наличия большого количества bad секторов на твоём винте.

Я неделю назад переустановил систему.
Дефрагментацию выполняю ежемесячно программой Start System Mechanic 5 Professional.

Geniy

Выполнил проверку.
Ошибок не обнаружено.

1.Перемести файл подкачки на другой раздел (своп-файл виртуальной памяти).
2. Почисти папки временных файлов Windows\Temp и ещё в Documents&Setting ищи, ну или там, где я не знаю, какое значение у переменных окружения temp и tmp.
3. Отруби службу восстановления системы (она пишет откаты регулярно).
4. Ну могу предположить руткита с кейлоггером, который пишет крутые отчёты в скрытое место на диске и съёдает дисковое пространство, но это врядли...так как ИМХО ты не правильно определил объём файлов которые занимают место на диске (не учёл скрытые системные).

P.S. Patition Magic тебе поможет, смотри в ней скока чего в каждом разделе и есть ли ошибки в логической структуре диска и есть ли скрытые (не видимые винде разделы) на диске...