редактирование ресурсов, что вы понимаете под этими словами?

Обфурскация кода - изменение самого кода без затрагивания работоспособности самого кода программы.
Упаковка или сжатие - уменьшение "веса программы".

Это мне все понятно, не понятно зачем вам перезапись двоичных файлов и снова вопрос, что вы под этим подразумеваете?

Как по мне самый просто путь во названию вашего запроса это все таки обфкрскация кода + упаковка (если же она критична).