ну потому что не винда, где работает всё из под одной учетки

мускул из под одного пользователя

веб-сервер из под другого

файлы вообще могут принадлежать третьему юзеру

что можно почитать, хз даже, можно взять хеши из mysql.user, возможно помогут

а данные в базе с каким нибудь приложением взаимодействуют? так то можно с данными поиграться

кстати для pma сплоиты тоже есть, стоит прочекать