Вполне могло быть и так, что взяли господ на деле с критичной гостайной, которую нельзя озвучивать. Ну, например, в тыреной переписке чиновников кроме котиков и писем от любовниц\взяткодателей нашли еще что-нибудь, и это что-то попытались продать... А может отломили ящик кого-то очень крутого, и он обиделся... Но хакер попался важный да значимый, скрыть его исчезновение с поста не выйдет, сейчас не 37й год. Журналистам надо что-то сказать, куда он делся и за что его так. Вот и сфабриковали спектакль для публики.
В версию внутренних разборок не верю, ибо можно было просто найти формальный повод для увольнения и под расписку о неразглашении выгнать того, кто перестал устраивать систему.