многие программы ведут логи своей работы, и большинство из них, сразу записывает их в файл. Каких то тормозов при работе этих программ, и при этом зачастую работают несколько из них я не заметил. И дополнительно, размер многих лог файлов неограничен, количество строк не считал.

1) Отруби встроенный Windows Defender (поставь Kaspersky Free)
2) В политике конфиденциальности отруби вообще всё
3) Через администрирование - службы - выруби центр обновления windows
4) Поставь Raxco PerfectDiskи прогони пару раз и ещё разок при загрузке системы, чтобы прошла дефрагментация файлов системы
5) Наслаждайся жизнью

Помимо рекомендаций выше, вы можете рассмотреть возможность адаптации SSD. Я просто сделал это, и проблема решена.

В windows 10 в диспетчере задач можно раскрыть подробно все процессы и посмотреть, какой именно грузит диск и плясать от этого. В старых версиях это работало в отдельном приложении "производительность системы"

Тут скорее несколько вариантов.
Скачивание обновлений винды.
или память забивает поиск виндовый.
Вообще конечно увидеть бы диспетчер задач

Проверьте, может обновление качает. У меня такое было. В службы нужно зайти и там выключить обновления. Но у меня уже второй день сам включает и начинает качать. Так что может и не помочь.

Почти наверняка ставит или выкачивает обновления винды.

Такой же треш на одной из машин. Немного помогло отключение обновлений и защитника. Вообще на 10-ке без SSD не жизнь. Пока есть возможность, использую 7/8.1 на машинах.